Δίπλα στο ναό, στη νοτιοδυτική γωνία, υπήρχε ψηλό κωδωνοστάσιο με ρολόι που υπερείχε κάθε άλλου κτίσματος της πόλης. Στη διάρκεια της πολύχρονης πολιορκίας της πόλης από τους Οθωμανούς, οι καμπάνες έδιναν το σύνθημα του συναγερμού σε περιπτώσεις βομβαρδισμού. Γι' αυτό, πολλές φορές, το κωδωνοστάσιο αποτέλεσε στόχο των τουρκικών πυροβόλων.

Ο Μαρίνος Τζάνε Μπουνιαλής διηγείται σχετικά: «... Δεν έπαυτε να ρίχτη λουμπάρδες στα καμπαναρειά κ' εις πάσα πλούσιο σπίτι, στ' Αγίου Μάρκου το ναό και στο καμπαναρειόν του, να σπάσου την καμπάνα του πού 'τον ο θάνατός του: όταν εδίδαν πόλεμον ελάλει και γροικούσαν πώς κατεβαίνουν οι εχθροί κι όλοι μαζί εγλακούσαν.»