Πρωτεύουσα και διοικητικό κέντρο παραμένει το Κάστρο που μετονομάζεται πλέον σε Κάντια (Candia), μία πόλη με εξαίρετη οικονομική και πνευματική κίνηση. Χαρακτηριστικό της σημασίας της είναι το γεγονός ότι το όνομα της πόλης χρησιμοποιείται πλέον για να προσδιορίζει ολόκληρη τη διοικητική περιφέρεια της Κρήτης που ονομάζεται Βασίλειο της Κάντια (Regno di Candia).
Η σύνδεσή της με τους θαλάσσιους εμπορικούς δρόμους και η εγκατάσταση Ενετών αποίκων αναζωογονούν την πόλη. Οι ευνοϊκές αυτές συνθήκες οδηγούν σε αύξηση του αστικού πληθυσμού και σε νέες επεκτάσεις έξω από τον παλαιό οχυρωματικό περίβολο. Το γεγονός αυτό, σε συνδυασμό με εκτεταμένη πλέον χρήση της πυρίτιδας και του πυροβολικού, υποχρεώνει τους Βενετούς να σχεδιάσουν και να κατασκευάσουν τη νέα οχύρωση της πόλης. Η διαμόρφωση του λιμανιού και η οικοδόμηση πλήθους εντυπωσιακών δημόσιων και ιδιωτικών οικοδομημάτων αλλάζουν ριζικά τη φυσιογνωμία της πόλης.
