Στη διάρκεια των οθωμανικών χρόνων, οι Οθωμανοί θεωρούν ελλιπή την ασφάλεια του λιμανιού. Αποφασίζουν, λοιπόν, την ενίσχυσή του με την κατασκευή ενός νέου φρουρίου, μικρότερου σε μέγεθος από τον ενετικό Κούλε. Ο Μικρός Κούλες των Οθωμανών, που βρίσκεται απέναντι ακριβώς από το ενετικό φρούριο, κατεδαφίζεται το 1936.