Το θύρωμα του καθολικού της Μονής του Αγίου Φραγκίσκου βρίσκεται σήμερα εντοιχισμένο στο συγκρότημα των Δικαστηρίων και αποτελεί την κεντρική είσοδο επί της σημερινής λεωφόρου Δικαιοσύνης.

Κατά τις ανασκαφικές εργασίες για την επέκταση του Αρχαιολογικού Μουσείου και εντός του περιβόλου του, αποκαλύφθηκαν αρχιτεκτονικά τμήματα που ανήκουν σε κτίρια της μονής καθώς και οι ταφικές κρύπτες.

Γενική άποψη του θυρώματος του καθολικού της Μονής του Αγίου Φραγκίσκου που βρίσκεται σήμερα εντοιχισμένο στο συγκρότημα των Δικαστηρίων και αποτελεί την κεντρική είσοδο, επί της σημερινής λεωφόρου Δικαιοσύνης, 2007 (φωτ. Εργαστήριο Πολυμέσων)
Λεπτομέρεια από το θύρωμα του καθολικού της Μονής, 2007 (φωτ. Εργαστήριο Πολυμέσων)
Από την ανασκαφή στο προαύλιο του Αρχαιολογικού Μουσείου όπου διακρίνεται ένας από τους σκελετούς, πιθανόν από τη διάρκεια του Κρητικού Πολέμου, 1983 (Ηράκλειο, 13η Εφορία Βυζαντινών Αρχαιοτήτων)
Από την ανασκαφή στο προαύλιο του Αρχαιολογικού Μουσείου όπου διακρίνονται οι ταφικές κρύπτες με τους σκελετούς, πιθανόν από τη διάρκεια του Κρητικού Πολέμου, 1983 (Ηράκλειο, 13η Εφορία Βυζαντινών Αρχαιοτήτων)
Από την ανασκαφή στο Αρχαιολογικό Μουσείο όπου διακρίνονται σκελετοί σε πρόχειρη ταφή, πιθανόν υπερασπιστές του Χάνδακα κατά τη διάρκεια του Κρητικού Πολέμου, 1983 (Ηράκλειο, 13η Εφορία Βυζαντινών Αρχαιοτήτων)
Το πρόπυλο της μονής του Αγίου Φραγκίσκου στο προαύλιο του Αρχαιολογικού Μουσείου, που αποκαλύφθηκε κατά τη διάρκεια ανασκαφικής έρευνας το 1983 (Ηράκλειο, 13η Εφορία Βυζαντινών Αρχαιοτήτων)